Seule partie non consommable de l'oeuf, la coquille représente une barrière physique qui empêche toute pénétration microbienne. Il existe notamment deux membranes, composées de minces couches de fibres protéiques et situées entre la coquille et le blanc, qui adhèrent à ceux-ci. Mais cette barrière permet tout de même des échanges gazeux [c'est-à-dire échappement de dioxyde de carbone (CO2) et introduction de dioxygène (O2)] et d'humidité. Elle préserve ainsi les qualités internes de l'oeuf.

Elle est constituée pour 95% de minéraux (carbonate de calcium sous forme de cristaux de calcite). De plus, sa solidité lui permet de résister à 3kg en pression statique pour une épaisseur de coquille de 0,33 mm.